环境科学与工程专业是一级学科学术硕士点，依托环境科学与工程学科、农业资源与环境学科，设有环境科学、生物质绿色转化与资源利用、农林碳汇与气候变化应对三个特色二级学科。学位点拥有森林食物资源挖掘与利用全国重点实验室（共建）、亚热带森林资源培育与高效利用学科创新引智基地、国家林业和草原局竹林碳汇工程技术研究中心、全省土壤修复与质量提升重点实验室、浙江-西班牙农业环境新污染物联合实验室、浙江农林大学生态环境与健康研究院（共建）、双碳技术联合研发中心（共建）等8个国家级和省部级科研创新平台，实验室面积达3570 m²，仪器设备总值超4450万元。学位点专任教师39人，其中教授18人，副教授16人，拥有“全国高校黄大年式教师团队”，国家级人才2人，省部级人才8人。近五年获批国家重点研发计划项目、国家自然科学基金项目、浙江省杰出青年科学基金项目、浙江省重点研发计划等国家级和省部级纵横项目共计251项，到账总经费累计达7730万余元。在《Environmental Science & Technology》、《Water Research》、《Soil Biology and Biochemistry》等SCI一区Top期刊上发表论文30余篇；获得浙江省科技进步一等奖1项。