森林保护学作为林学学科下设的学科专业，重点开展森林-昆虫-微生物互作机制、森林健康与绿色防控、绿色药剂研发及配套技术、森林昆虫及微生物资源多样性等研究，形成了具有鲜明特色和国内外影响的研究方向，在森林-昆虫-微生物互作理论、绿色药剂研发及应用、区域特色昆虫分类、经济林病害成灾机制等方面，处于领先水平。学科现有教授9人，研究员3人，博士生导师9人，硕士生导师17人，新世纪百千万人才工程国家级人选1名，省突出贡献中青年专家1名，省万人计划教学名师1名，浙江省“151”人才8人（第一层次2人），高校中青年学科带头人3人。建有生物农药高效制备技术国家地方联合工程实验室、浙江省绿色农药2011协同创新中心、亚热带森林健康与生物安全国际科技合作基地等科研平台。实验室专用面积5400平方米，仪器设备3000余万元。近5年来，学科共承担国家级、省部级项目等课题近100项，到位经费4000余万元；发表论文近200篇，其中SCI收录100余篇，授权专利30余项，出版专著、教材10部。先后获得浙江省科学技术进步奖一等奖1项、教育部高等学校优秀科技成果奖二等奖1项，梁希林业科技进步奖二等奖2项。