01森林食物资源研究与开发：依托浙江省农林产业的特色优势，主要围绕山核桃、香榧、栀子等森林食物新资源开发与利用、功能因子挖掘与品质提升的前瞻性基础理论和加工过程中的科学问题开展研究。

02食品生物技术与合成生物学：主要围绕植物功能成分生物制造，甘露糖、葡聚糖等功能性多糖的生物合成关键酶筛选及改造，脂肪酶、糖苷酶等食品酶资源筛选及功能性食品智造等领域开展研究。

03食品安全快检技术：主要围绕区域特色食品生产与加工中的潜在危害因子的快速检测、特色农林产品品质监控、危害物仿生识别与快速检测等方面开展研究。

04食品毒理与安全评价：主要围绕食品典型污染物的高通量筛查、健康风险评估、新型食品污染物毒性效应及致毒机制等领域开展研究。

05食品微生物：主要围绕食品加工贮藏中有害微生物控制、食源性病原微生物控制靶点筛选及绿色抑菌剂开发、益生菌与食品制造等领域开展研究。