01森林食物加工与贮藏工程：主要研究山核桃、香榧、茶叶等农林特产的保鲜、加工过程物理、化学和生物化学变化规律，及其影响品质的机制。

02粮油加工与贮藏工程：主要围绕中温高湿区粮食贮藏过程中的生理生态调控保鲜、有害生物绿色防治、储藏智慧化管理以及粮食制品加工、组分互作机制及功能化等领域开展研究。

03亚热带果蔬加工与贮藏工程：主要围绕甘薯、竹笋、柑橘、蓝莓等区域特色果蔬，研究食品加工过程中的科学技术与工程问题，结合现代食品加工新技术，探讨其加工特性及其变化规律，实现农产品加工增值和传统食品现代化。

04食品分子营养学与药食两用资源营养评价：以小鼠、线虫、斑马鱼等为模式，研究区域特色资源营养因子挖掘、制备、评价和营养分子机制。

05特膳食品与慢性疾病营养干预：研究石斛多糖、黄精益生元、金线莲苷、功能性栀子油等区域特色资源营养因子挖掘、制备、评价和产品开发等开展研究。